基因组DNA的质量控制分析
基因组DNA的质量控制分析
首先隔离在1800年代中期,基因组DNA (gDNA)组成生物体的染色体DNA。它包含所有生物体的生物信息直接其细胞功能,也传递给下一代。
gDNA序列携带信息组织在基因和其他离散遗传元素,而研究人员可以访问通过隔离遗传物质和测序或操纵它。这种访问是由基因组的组织或结构,和化学和物理修改DNA,包括相关的小分子和蛋白质绑定。基因组分析帮助科学家更好地理解函数,互动,调节特定基因控制有机体的发展。
是否你的研究应用程序使用新一代测序(门店),基因编辑、克隆、基因分型,开始你的实验与高质量、高度集成的DNA有助于确保强劲的结果。
雷竞技raybet安捷伦gDNA质量分析提供了一个投资组合的解决方案,包括仪器、试剂包,和软件使您能够成功评估DNA大小、完整性和浓度。实现可靠的结果与自动化和可伸缩的吞吐量。
你可以依赖基因组DNA的质量控制分析
分子生物学家和遗传学家雇佣许多应用程序需要gDNA和高质量的DNA样本生成可靠的、健壮的结果。评估样品的质量是很重要的。
安捷伦科雷竞技raybet技公司的自动电泳组合包含一系列工具,提供优势的吞吐量可伸缩性、灵敏度、速度和分辨率。往下读,了解如何进行完整gDNA上级评估,包括准确的资格,分级和量化。
增加与片段分析仪系统的吞吐量
雷竞技raybet安捷伦的片段分析仪系统为您提供健壮的gDNA分析解决方案,以适应任何吞吐量需求——从12样品大约一个小时,24小时内超过2400的样品。
有两包旨在分析gDNA:
- 基因组DNA 50 kb工具包(p / n dnf - 467)通过60 kb提供自信gDNA涂片的评估。一个200倍稀释极大地简化了样品制备,节约研究时间。
- HS基因组DNA 50 kb工具包(p / n dnf - 468)通过60 kb提供分级gDNA涂片,低浓度样品。
GQN:实证评估的质量
雷竞技raybet安捷伦的片段分析解决方案允许容易和经验评估gDNA质量与一个动态质量指标。大豆蛋白松香胶数据分析软件计算基因组质量数量(GQN) gDNA涂片值介于0到10,简化的比较质量。
涂片分析提高准确度和精密度
雷竞技raybet安捷伦的片段分析解决方案也支持特定的分析浓度和规模(bp) gDNA涂片检查一个用户定义的大小范围内。涂片分析功能为研究人员提供了下游应用程序要求的准确度和精密度。
与安捷伦TapeStation系统简化电泳雷竞技raybet
高质量的输入gDNA样本对下游的应用程序来说都是必不可少的,如上天。
的TapeStation系统提供简单和基因组DNA的快速自动电泳分离。这是补充的基因组DNA ScreenTape化验5067 - 5365 (p / n和5067 - 5366年)提供准确的定量和可靠的质量分析的96个样本从200年到60000年英国石油公司在不到两分钟。
的TapeStation软件提供了一个自动化、客观质量评分,DNA完整性(DIN)数量。喧嚣范围从1到10,表明gDNA样本的质量评估其分布在整个大小范围。较低的喧嚣更退化相关样本,而高鼎将表明质量好的样本,允许研究人员作出更明智的决定。
gDNA样品降解四个阶段分析了TapeStation系统与基因组DNA ScreenTape化验,以确定DNA完整性和样品浓度。上图所示(一个)凝胶图像与相应的喧嚣显示下面每一个车道,和(B)相应的electropherogram覆盖的所有gDNA样本。
gDNA的详细信息和准确的分级
对于应用程序来说,它需要更详细的信息和准确的DNA分级高于60 kb,长阅读测序等毫微微脉冲系统是理想的。一个精心设计的光学检测平台以前所未有的敏感性,毫微微脉冲系统足够灵活,能够处理任何工作流场景。基因组DNA的165 kb工具包(p / n fp - 1002)使用pulsed-field毛细管电泳,高分子量大小通过前所未有的165 kb gDNA涂片,在大约1.5小时。
此外,大豆蛋白松香胶数据分析软件工具使用片段分析仪系统可以用于大型gDNA涂片毫微微脉冲系统分析。这为您提供了更多的高分子量的样品的详细信息。
图像显示结果当pulsed-field毛细管电泳进行使用毫微微脉冲系统配备一个毫微微脉冲12-Capillary数组。electropherogram上的蓝色的点线代表了大小阈值选择GQN决心,和垂直红线表示涂片分析范围。对于此示例,用户定义的阈值为50000 bp GQN为8.6,表明样品大于阈值的86%。
仅供研究使用。不用于诊断程序。
敏感分析退化和FFPE gDNA
gDNA已经支离破碎或退化——例如,formalin-fixed,石蜡包埋(FFPE) gDNA - QC分析提出了独特的挑战。质量得分FFPE gDNA和退化gDNA是复杂的,通常需要研究人员做出最佳猜测当使用传统的琼脂糖凝胶电泳。
例如,gDNA提取FFPE组织经常进行剪切和交联与蛋白质和其他分子,经常导致一个复杂的和复杂的分离。雷竞技raybet安捷伦自动电泳系统的范围,包括片段分析仪,TapeStation和毫微微脉冲系统使研究人员提取可靠的结果甚至从FFPE gDNA。
虽然FFPE gDNA通常有一个低完整性,了解样品的质量可以允许用户修改某些工作流为这些样品。例如,分散条件可以适应基于最初的完整示例。雷竞技raybet安捷伦的片段分析和毫微微脉冲解决方案能够准确评估FFPE gDNA质量和完整性有两个指标:基因组质量数量,和DNA完整号码。
的大豆蛋白松香胶数据分析软件计算基因组质量数量(GQN) gDNA涂片值介于0到10,使得实证质量评分策略。的基因组DNA ScreenTape化验TapeStation系统提供了一个客观的测量DNA完整性通过DNA完整性(DIN)数量。
工作的喧嚣的样本FFPE gDNA
图像显示的结果FFPE gDNA样品不同的完整性TapeStation系统上使用基因组DNA分离ScreenTape化验。结果显示为electropherogram叠加和数字凝胶图像,每个凝胶巷与下面列出的喧嚣。
仅供研究使用。不用于诊断程序。
发现安捷伦全面的基雷竞技raybet因组DNA (gDNA)组合分析工具
雷竞技raybet安捷伦提供了几种gDNA的有效和可靠的分析用仪器测量解决方案。片段分析仪、TapeStation和毫微微脉冲系统,适当的化验和试剂盒,提供优越的分析与无与伦比的分辨率和分级功能。
仪器 | 零件号 | 试剂包名称 | 大小范围 | 定量范围 | 质量指标 |
---|---|---|---|---|---|
片段分析仪系统 | dnf - 467 - 0500 | 基因组DNA 50 kb工具包 | 75年至60000年英国石油公司 | 25 - 250 ng /µL | GQN |
dnf - 468 - 0500 | HS基因组DNA 50 kb工具包 | 75年至60000年英国石油公司 | 0.3到12 ng /µL | GQN | |
TapeStation系统 | 5067 - 5365 5067 - 5366 |
基因组DNA ScreenTape 基因组DNA试剂 |
200 - > 60000个基点 | 10到100 ng /µL | 喧嚣 |
毫微微脉冲系统 | fp - 1002 - 0275 | 基因组DNA 165 kb工具包 | 1300年至165000年英国石油公司 | 片段:5 - 500 pg /µL 涂片:0.3到30 pg /µL |
GQN |
仅供研究使用。不用于诊断程序。
阅读更多关于gDNA分析在我们的应用程序中。
评估与安捷伦5200片段基因组DNA质量分析仪系统雷竞技raybet安捷伦5雷竞技raybet200片段分析仪提供了轻松的分析基因组DNA (gDNA)基因组DNA 50 kb装备和HS基因组DNA 50 kb工具包。
基因组DNA在安捷伦毫微微脉冲大小和质量控制系统雷竞技raybet高分子量分离gDNA,提供准确的,可再生的分级使用安捷伦毫微微脉冲系统和质量控制。雷竞技raybet
基因组DNA提取与安捷伦毫微微脉冲系统雷竞技raybet安捷伦毫雷竞技raybet微微脉冲系统是唯一的自动化系统能够取代隔夜但是脉冲场凝胶电泳的出现高分子量分析gDNA只有70分钟,节省时间和金钱。
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使用安捷伦4200 T雷竞技raybetapeStation系统全外显子组测序样品质量控制的工作流德国癌症研究中心(DKFZ)质量控制步骤包括量化和资格的DNA,并可以用4200 TapeStation系统。
回顾从海德堡CardioBiobank质量分析的DNA样本这个应用程序注意演示了使用安捷伦4150 TapeStation系统的质量控制(QC)工具来分析DN雷竞技raybetA样本存储在海德堡CardioBiobank (HCB)。
仅供研究使用。不用于诊断程序。