RNA样本质量控制分析
RNA是什么?
分析核糖核酸(RNA),研究最多的生物大分子之一,是至关重要的理解基因表达和调控的细胞过程,如细胞分裂和细胞生长。因为这些至关重要的角色,研究人员感兴趣的RNA分子寻求生物学的深入了解。必须从活细胞中提取RNA,子序列分析前和纯化。
RNA中可以找到许多不同的亚型,长度和形状,很容易退化。因此,要自信地产生强劲的结果从RNA分析、样品质量控制(QC)的下游分析是非常有益的。
雷竞技raybet安捷伦提供一系列量化、资格和分级解决方案允许可靠的评估样本。这包括具有挑战性的样品如formalin-fixed石蜡包埋(FFPE) RNA的标本。
仅供研究使用。不用于诊断程序。
总RNA资格
帮助的经验评估总RNA,每个系统功能质量度量客观评估的RNA质量:RNA完整性(RIN)的数量生物分析仪系统,RNA质量(RQN)的数量片段分析仪和毫微微脉冲系统和RNA完整性等效(RIN数量e)TapeStation系统。
雷竞技raybet安捷伦科技公司的解决方案帮助研究人员通过自动计算每个样本的质量分数,考虑核糖体山峰之间的比率,小RNA地区,山峰之间的分辨率。报告指标在1到10的规模,与更高的值指示一个更高质量的总RNA样本。
2100生物分析仪系统的快速评估
的2100生物分析仪系统提供了两个包对准确RNA质量控制:
- RNA 6000纳米设备(p / n, 5067 - 1511年)
- RNA 6000 Pico工具包(p / n, 5067 - 1513年)
包都有一个特定的分析为原核和真核核糖核酸RNA样本和工厂。核糖体的功能,如自动RIN评估、计算比率,和这些化验提供的定量数据2100年生物分析仪RNA质量控制的标准。
从人类淋巴组织总RNA的提取分离。粉色和绿色线指定18岁和28 s核糖体RNA的峰值,分别。核糖体峰前出现的小片段的象征是小RNA。使用RNA电泳进行6000纳米装备2100生物分析仪系统。这个示例RIN的9.8,表明高质量的RNA。
一致的总RNA片段分析解决方案
的片段分析仪系统有两个试剂盒的一致的评估总RNA质量、数量、和大小:
- RNA工具包(15元)(p / n dnf - 471)
- HS RNA工具包(15元)(p / n dnf - 472)
大豆蛋白松香胶数据分析软件RQN自动计算量化质量分数,对于每一个样本。出色的解决这些工具为研究者提供了一个明确的观点独特的概要文件的总RNA,分开小和退化的RNA,使得RQN准确。
通用鼠标参考总RNA分离。紫色和粉色的峰值代表了大型和小型核糖体RNA山峰,分别。下面的小片段看到200元是指示性的小RNA。毛细管电泳进行使用RNA片段分析仪系统工具包(15元)配备短毛细管阵列,33厘米。RNA属性总结(嵌入)包括样品浓度,核糖体比率和RNA质量数量(RQN)。这个示例的RQN 9.9,表明高质量的RNA。
高效、简单的DNA和RNA样本与TapeStation系统质量控制
的TapeStation系统为有效和可靠的RNA表征提供两个化验,质量评估,并量化:
- RNA ScreenTape化验(p / n, 5067 - 5576年)
- 高灵敏度RNA ScreenTape化验(p / n, 5067 - 5579年)
RIN的eRIN直接可比的生物分析仪系统和提供快速和客观评价的RNA完整性真核和原核的总RNA样本。
四只老鼠总RNA样本(300 ng /μL)分析了不同级别的RNA降解TapeStation系统上使用RNA ScreenTape化验。该决定RINe值显示在凝胶图像。较低的RINe表示更退化的样本,而更大的RINe表明高质量的RNA。
敏感的毫微微脉冲系统
超敏感性RNA工具包(p / n fp - 1201)保存珍贵的样本,同时为低浓度适当的会计记录在一个总RNA样本。它使总RNA和mRNA的定量和定性分析,从200年到6000元超低浓度。的大豆蛋白松香胶数据分析软件和RQN质量指标是兼容的毫微微脉冲总RNA,使先进的质量分析低浓度样品。
通用鼠标参考总RNA分离。紫色和粉色的峰值代表了大型和小型核糖体RNA山峰,分别。毛细管电泳是使用美国执行RNA毫微微脉冲系统工具包。RNA属性总结(嵌入)包括样品浓度,核糖体比率和RNA质量数量(RQN)。这个示例的RQN 10.0,表明高质量的RNA。
仅供研究使用。不用于诊断程序。
减少污染和误解在信使RNA
信使核糖核酸(mRNA)为研究人员提供了洞察基因活性。大规模测序的mRNA使研究人员能够配置哪些基因和基因组区域是活跃的。在一个典型的工作流涉及mRNA,总RNA是首次分析了样本的完整性在核糖体RNA (rRNA)损耗,确保RNA不退化。
mRNA然后分析与试验验证残余rRNA内容较低,较低的百分比显示rRNA污染得分。与其他门店应用程序一样,适当的mRNA QC分析核酸确保只有合适的样品处理。
基因表达定量应用还依赖于完整的信使RNA,退化的总RNA可能导致缺乏一些记录,和误解的结果。样品质量评估有助于确保感兴趣的mRNA的完整性,并保证示例包含最小污染rRNA,这可能会干扰健壮的下游分析。
可靠的信使RNA和QC分析ribo-depleted总RNA与安捷伦实现雷竞技raybet自动电泳组合。
信使rna的准确评估,使用:
- RNA的mRNA分析6000纳米(p / n, 5067 - 1511年)6000年和RNA皮科(p / n, 5067 - 1513年)2100生物分析仪系统工具
- HS RNA工具包(15元)(p / n dnf - 471)片段的分析系统
- 超敏感性RNA工具包(p / n fp - 1201)毫微微脉冲系统
片段分析仪系统
信使核糖核酸(mRNA)样本中提取和纯化大鼠肾脏组织。毛细管电泳进行HS RNA设备使用信使RNA分离方法在片段分析仪系统配备短毛细管阵列,33厘米。mRNA属性总结表明核糖体污染出现在样品的百分比,在本例中为13.6%。
毫微微脉冲系统
一只老鼠的肾脏分离mRNA在低浓度样品(30 pg /µL)。毛细管电泳进行使用超敏感性RNA毫微微脉冲系统工具包。mRNA属性总结表明核糖体污染出现在样品的百分比,在本例中为6.8%
在体外诊断和转录信使核糖核酸(mRNA)
在体外(溶)mRNA转录成为研究领域广泛,如核糖酶和适体合成,信使RNA合成,RNA干扰,反义RNA技术。
虽然传统溶mRNA正在100个核苷酸长度、长RNA转录现在被用于基因结构和功能的研究。需要可靠的RNA质量控制步骤来生产这些合成RNA。分级、量化和质量评估的早期mRNA的大小从200到6000元可以获得使用片段分析仪系统RNA设备(15元)(p / n dnf - 471)。时间记录超过6000元,可以使用一个扩展的方法。
仅供研究使用。不用于诊断程序。
清晰的分辨率和高灵敏度小RNA分析解决方案
小RNA是一个广泛的和不断增长的分类,包括:微RNA (microRNA的),小干扰RNA (siRNA) PIWI-interacting RNA (piRNA),和小核RNA(核内小RNA)。分析小分子rna通常是困难的许多分析方法缺乏准确分离所需的最小分辨率和灵敏度,分级和量化。
的生物分析仪和片段分析仪系统非常适合于最高灵敏度,变量的吞吐量,和非凡的分辨率要求小RNA QC分析:
- 生物分析仪小RNA工具包(p / n, 5067 - 1548年)
- 片段分析仪小RNA工具包(p / n dnf - 470)
2100生物分析仪系统
从小鼠胸腺和分离提取的总RNA样本2100生物分析仪系统使用小RNA分析。绿线之间的区域代表了小RNA,而紫色虚线表明微区域(10到40元)。表(嵌入)给该地区的平均大小,粒度分布,和每个地区的浓度,以及样本的比例小RNA和微RNA。
片段分析仪系统
从水稻根和分离提取的总RNA样本使用小RNA工具包。毛细管电泳进行片段分析仪系统配备短毛细管阵列,33厘米。紫线electropherogram表明不同地区的样本:微区域(10到40元)和小RNA地区200元(10)。小RNA汇总表(嵌入)给微RNA样本的比例,随着浓度的小RNA和microRNA的地区。
仅供研究使用。不用于诊断程序。
质量指标的独特QC FFPE RNA的挑战
可靠的质量控制分析FFPE RNA对自信的门店结果至关重要。FFPE RNA样本表现出更高水平的降解和交联,限制了这些样品的RNA质量指标的有效性。
的自动电泳系统安捷伦科技雷竞技raybet公司利用质量度量,DV200年,解决独特的QC FFPE RNA的挑战。DV200年为研究人员提供了一个可靠的工具按大小分类降解RNA和有效解析不合适的样品的样品适合挥动,节约时间和成本。根据水平的退化和DV200年分数,研究人员可以修改他们的工作流程,还使FFPE样本在下游应用程序的使用。例如,当一个特定的大小需要和样品稍微降低,剪切协议可以调整达到这一规模。利用自动化评估的RNA样品使用DV200年质量指标与任何自动化的电泳平台:
- 生物分析仪RNA 6000纳米设备(p / n, 5067 - 1511年)6000年和RNA Pico工具包(p / n, 5067 - 1513年)与DV200年化验
- 片段分析仪RNA工具包(15元)(p / n dnf - 471)和HS RNA工具包(15元)(p / n dnf - 472)
- TapeStation RNA ScreenTape化验(p / n, 5067 - 5576年)和高灵敏度RNA(p / n, 5067 - 5579年)ScreenTape化验
2100生物分析仪系统
FFPE RNA提取和纯化的前列腺组织。使用DV电泳进行200年核糖核酸纳米2100生物分析仪系统的分析2100专家软件。对于此示例,DV200年分数是45%。
片段分析仪系统
FFPE RNA样本分开使用HS RNA片段分析仪系统工具包(15元)。毛细管电泳进行短毛细管阵列,33厘米。在大豆蛋白松香胶数据分析软件,红线electropherogram表明DV200年地区。对于此示例,DV200年分数为22.6%,表明一个小样本的百分比是200元以上。
TapeStation系统
比较不同DV FFPE RNA样本200年价值观和典型electropherogram概要文件。样品进行了分析与RNA ScreenTape TapeStation系统分析。
仅供研究使用。不用于诊断程序。
RNA分析工具
自动电泳仪器从安捷伦RNA为质量控制提供有效的解决方案分析:生物分析仪,片段分析仪,TapeS雷竞技raybettation,毫微微脉冲系统。与相关试剂盒,仪器提供无与伦比的分级和量化能力。
仪器 | 零件号(s) | 试剂包名称 | 大小范围 | 定性范围 | 质量指标 |
---|---|---|---|---|---|
2100生物分析仪系统 | 5067 - 1511 | RNA 6000纳米装备 | - - - - - - | 25 - 500 ng /µL | RIN、DV200年 |
5067 - 1513 | RNA 6000 Pico工具包 | - - - - - - | 50 - 5000 pg /µl | RIN、DV200年 | |
5067 - 1548 | 小RNA工具包 | 6 - 150元 | 50 - 2000 pg /µl | - - - - - - | |
片段分析仪系统 | dnf - 470 - 0275 | 小RNA工具包 | 15 - 200元 | 25 - 2500 pg /µL | RQN, DV200年 |
dnf - 471 - 0500 dnf - 471 - 1000 |
RNA工具包(15元) | 200 - 6000元 | 5 - 500 ng /µL | RQN, DV200年 | |
dnf - 472 - 0500 dnf - 472 - 1000 |
HS RNA工具包(15元) | 200 - 6000元 | 50 - 5000 pg /µL | - - - - - - | |
TapeStation系统 | 5067 - 5576(ScreenTape) 5067 - 5577(缓冲) 5067 - 5578(阶梯) |
RNA ScreenTape | - - - - - - | 25 - 500 ng /μl | RINe,DV200年 |
5067 - 5579(ScreenTape) 5067 - 5580(缓冲) 5067 - 5581(阶梯) |
高灵敏度RNA ScreenTape | - - - - - - | 1000 - 25000 pg /μl | RINe,DV200年 | |
毫微微脉冲系统 | fp - 1201 - 0275 | 我们的RNA设备 | 200 - 6000元 | 2.5 - 250 pg /µL | RQN |
仅供研究使用。不用于诊断程序。
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DV200评价与RNA ScreenTape化验本技术概述描述的简化评估DV200使用RNA ScreenTapeand高灵敏度RNA ScreenTape 4200 TapeStation系统。
仅供研究使用。不用于诊断程序。